В связи с тем, что в 2005 году Мурад Шарифходжаевич Шарифходжаев начал исполнять полномочия Председателя Сената Олий Мажлиса Республики Узбекистан, обязанности ректора были возложены на ранее работавшего на должности проректора по учебной работе доктора экономических наук, профессора Алишера Васиковича Вахабова.

 В 2012 году профессор Алишер Васикович Вахабов был назначен Министром высшего и среднего специального образования Республики Узбекистан. В январе 2013 года ректором института был назначен талантливый ученый-практик, кандидат экономических наук, доцент Азизов Улугбек Уктамович.

 В связи с переходом в 2016 году Улугбека Уктамовича Азизова на ответственную работу в Кабинет Министров Республики Узбекистан, на должность ректора института был назначен ранее работавший заместителем Председателя Государственного Комитета по статистике, доктор экономических наук, профессор Бегалов Бахадыр Абдусаламович.

 В связи с переходом в 2017 году Бегалова Бахадыра Абдусаламовича на должность Председателя Государственного Комитета по статистике, на должность ректора Ташкентского финансового института был назначен доктор экономических наук, профессор Хайдаров Низомиддин Хамраевич, ранее успешно осуществлявший свою деятельность на всех ступенях вузовской системы управления.

 С сентября 1991 года в Ташкентском финансовом институте начали свою деятельность 3 очных факультета – финансово-экономический, кредитно-экономический и учетно-экономический факультеты, 2  заочных   факультета  – кредитно-экономический и финансово-учетный экономический факультеты  соответствующими  направлениями обучения, а также 20 кафедр. Начиная с 1993 года началась подготовка кадров по направлениям обучения  налоги и налогообложение, страховое дело, ценные бумаги и биржевое дело. Начиная с 1998-1999 учебного года в Ташкентском финансовом институте в целях подготовки кадров по направлению  финансирование проектов была открыта кафедра “Финансирование инвестиционных проектов”.

 С 1999 года начался прием на учебу по педагогическому образованию по направлению бухгалтерский учет и аудит. В 2004 году на базе учетно-экономического и кредитно-экономического факультетов был образован факультет финансового менеджмента. Данный факультет стал готовить бакалавров по направлениям обучения профессиональное образование, статистика и менеджмент.

 На основании приказа ректора института № 137 от 27 августа 2005 года на базе направлений налоги и налогообложение и страховое дело финансово-экономического факультета был образован факультет налоги и страховое дело. Начиная с 2011-2012 учебного года он был переименован в факультет страхование.

 На основании приказа ректора института №153 от 19 октября 2007 года на базе кафедры финансы была образована кафедра «Казначейское дело». В 2007 году на базе кафедры «Банковское дело» была образована кафедра  «Банковский учет и аудит». В 2005 году кафедра  «Макро и микроэкономика» была переименована в кафедру «Бизнес и экономика»,  которая  вошла       число   спец кафедр.    5 ноября 2007 года на базе направлений  финансовый инжиниринг, рыночная деятельность и операции на рынке и  финансирование инвестиций был образован факультет финансирование проектов.

 В связи с открытием в 2007 году двух новых направлений – финансовый инжиниринг и  рыночная деятельность и операции на рынке была образована кафедра «Финансовый инжиниринг и рынки», а с 2010 года она была переименована в кафедру «Финансовые рынки и ценные бумаги».

 30 мая 2009 года кафедра «Экономическая теория и экономическая педагогика» была разделена на кафедру «Экономическая теория» и кафедру  «Педагогика и психология».

 На основании приказа ректора института за № 44 от 10 февраля 2010 года на базе кафедры “Бухгалтерский учет” была образована кафедра “Бюджетный учет”. В 2009 году в соответствии с требованием времени общеэкономический факультет был переименован в факультет бюджетный учет и казначейство. С сентября 2009 года факультет называется факультет бюджетного учета и государственных фондов. С июня 2017 года кафедра «Философия, теория и практика построения демократического общества в Узбекистане и кафедра  «История Узбекистана” были объединены в одну единую кафедру под общим названием кафедра “Общественные науки”.

 Учитывая практику ведущих университетов мира, в 1999 году была создана Магистратура.

 В настоящее время в институте работают много заслуженных ученых республики. Среди них трое имеют звания “Заслуженный деятель науки Республики Узбекистан”, двое - “Заслуженный работник народного образования Республики Узбекистан”, двое – “Заслуженный экономист Республики Узбекистан” и один – “Заслуженный изобретатель и рационализатор Республики Узбекистан”.

 В 1999 году в институте был организован отдел «Информационное и техническое обеспечение». Его основная деятельность направлена на обслуживание имеющегося технического оборудования, объединение их в единую корпоративную сеть и развитие компьютерной сети в институте.

 В соответствии с Указом Президента Республики Узбекистан «Об организации информационного и библиотечного обеспечения населения Республики Узбекистан» №УП-381 от 20 июня 2006 года в Информационно-ресурсном центре Ташкентского финансового института были внедрены современные информационные технологии. Сегодня в фонде ИРЦ насчитывается в общей сложности более 650 000 экземпляров учебной,  научной  и другой   вспомогательной  литературы.

 Для реализации модели подготовки специалистов, соответствия их современным требованиям и мировым стандартам на 24 кафедрах и 6 факультетах института работают 453 преподавателя, из них – 40 докторов наук и профессоров, 132 кандидата наук и доцента.

 В соответствии с приказом №277 Министерства высшего и среднего специального образования Республики Узбекистан от 18 декабря 1995 года Ташкентскому финансовому институту был был придан статус базового высшего учебного заведения, к которому прикреплены шесть высших учебных заведения (АндМИИ, ККГУ, КарГУ, НамМИИ, ТермГУ, ФерПИ).

 В рамках международного сотрудничества институт установил взаимные связи с Аберсвифтским Университетом (Великобритания), Вусоунгским Международным Университетом Солбридж (Южная Корея), Индийским финансовым институтом (Индия), Университетом иностранных языков Ханкука (Южная Корея), Технологическим институтом Йоджу (Южная Корея), Университетом Синьцзяна (Китай), Кембриджской регилональной школой (Великобритания), Сандерлендским Университетом (Великобритания), Финансовым Университетом при Правительстве Российской Федерации (Российская Федерация), Университетом Байнери (Малайзия), Латвийским Университетом (Латвия), Университетом Миколаса Ромериса (Литва).

 С 2006 года институт входит в 1000 список лучших образовательных учреждений мира. А в 2008 году Ташкентский финансовый институт был награжден Европейским национальным комитетом знаком “Еurореаn quality” («Европейское качество»).    

 В соответствии с лицензией №058 Кабинета Министров Республики Узбекистан от 16 марта 2005 года в институте свою деятельность осуществляет издательство "IQТISОD-МОLIYА". В 2008 году был учрежден научно-экономический журнал института «Молия» и по решению Президиума ВАК Республики Узбекистан он включен в список научных журналов, публикации в которой признаются Высшей  аттестационной   комиссией.  С начала образования журнал «Молия» издавался четыре раза в год, а с 2011 года выходит шесть раз в год.

 В соответствии с уставом и структурой института в 1991 году был организован профсоюзный комитет института. Основной целью профсоюза является защита трудовых, социальных, экономических, духовных, интеллектуальных прав и интересов членов профсоюза. В настоящее время общее число членов профсоюза института составляет 5244 человека, из которых 453 являются преподавателями, 405 - сотрудниками и 4386 - студентами. С 1991 года по сегодняшний день в качестве руководителей этой организации С.X.Аблятифов, М.Эркабоев, И.А.Наврузов и нынешний председатель - профессор З.Ю.Юлдашев, который работает с 2007 года, проделали определенную работу по обеспечению прав и интересов членов профсоюза.